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課程名稱 |
生醫資料探勘
BIOMEDICAL DATA MINING |
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開課學期 |
94-2 |
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授課對象 |
生物資源暨農學院 生物產業機電工程學研究所 |
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授課教師 |
陳倩瑜 |
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課號 |
BME5419 |
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課程識別碼 |
631 U9470 |
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班次 |
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學分 |
3 |
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全/半年 |
半年 |
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必/選修 |
選修 |
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上課時間 |
星期三2,3,4(9:10~12:10) |
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上課地點 |
知204 |
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備註 |
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Ceiba 課程網頁 |
http://ceiba.ntu.edu.tw/942_BioDM |
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課程簡介影片 |
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核心能力關聯 |
核心能力與課程規劃關聯圖 |
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課程大綱
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為確保您我的權利,請尊重智慧財產權及不得非法影印
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課程概述 |
此一課程在於介紹資料探勘之演算法應用於生醫相關之研究。 |
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課程目標 |
使學生獲得從事生醫資料分析必須之基礎能力。 |
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課程要求 |
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預期每週課後學習時數 |
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Office Hours |
每週一 11:00~12:00
每週二 11:00~12:00 |
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指定閱讀 |
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參考書目 |
1. Statistical Methods in Bioinformatics : An Introduction, Warren J. Ewens,
Gregory Grant, Springer; 2 edition (February 5, 2006)
2. The Elements of Statistical Learning, T. Hastie, R. Tibshirani, J. H.
Friedman, Springer; 1 edition (July 30, 2003)
3. Exploration and Analysis of DNA Microarray and Protein Array Data, Dhammika
Amaratunga and Javier Cabrera, Wiley-Interscience, 2004. |
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評量方式
(僅供參考) |
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No. |
項目 |
百分比 |
說明 |
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1. |
期中考 |
30% |
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2. |
期末專題 |
30% |
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3. |
作業 |
40% |
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週次 |
日期 |
單元主題 |
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第1週 |
2/22 |
01.生醫資料探勘概論 |
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第2週 |
3/01 |
02.資料蒐集與前置處理 |
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第3週 |
3/08 |
03.微陣列資料概述 |
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第4週 |
3/15 |
04.R與Bioconductor, HAC |
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第5週 |
3/22 |
05.資料分群演算法 (I) |
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第6週 |
3/29 |
06.資料分群演算法 (II) |
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第7週 |
4/05 |
07.EM algorithm (民族掃墓節, 放假) |
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第8週 |
4/12 |
08.資料分群演算法 (III) |
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第9週 |
4/19 |
09.SOM + 基礎統計檢測方法 |
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第10週 |
4/26 |
10.資料分類演算法 (I) |
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第11週 |
5/03 |
11.期中考 |
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第12週 |
5/10 |
12.同學報告 |
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第13週 |
5/17 |
13.資料分類演算法 (II) |
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第14週 |
5/24 |
14.資料分類演算法 (III) |
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第15週 |
5/31 |
15.端午節(放假) |
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第16週 |
6/07 |
16.統計檢定基礎 |
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第17週 |
6/14 |
17.特徵分析 |
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第18週 |
6/21 |
18.蛋白質序列資料簡介/序列資料探勘 |
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第19週 |
6/28 |
19.Demo of Final Project |
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